No, no se puede tener más de una tienda en Shopify con tu cuenta de PagueloFacil. Shopify nos genera una llave única por cada tienda, esta llave es la que permite la comunicación entre Shopify y PagueloFacil por lo que debes crear otras cuentas de comercio en PagueloFacil.

Para crear otra cuenta en PagueloFacil recuerda que necesitas un correo diferente al de tu cuenta existente.